Firma Capcom podaje, że prace nad drugą częścią gry "Mega Man Zero" są już na ukończeniu. Druga część gry, tak jak pierwsza, będzie platformówką, w której główną postacią będzie tytułowy Zero - cybernetyczny elf. W "Mega Man Zero 2" posiądzie on znacznie więcej mocy niż w poprzedniczce, które będą pomagały mu rozprawiać się z napotkanymi przeciwnikami.
Capcom podaje również, że Zero w drugiej części swoich przygód będzie potrafił przybierać różnorodne formy. Daty premier "Mega Man Zero 2" na różnych kontynentach nie zostały jeszcze podane.